Die 450-jährige Geschichte lädt zur Reflexion über Epochen der bayerischen Bildungspolitik ein. Der Erfolg der gegenreformatorischen Politik im Herzogtum verdankte sich vorrangig dem pädagogischen Einsatz der Jesuiten. Nach der Auflösung des Ordens 1773 wirkten Alumni des Gymnasiums in der Akademie der Wissenschaften. Das Wilhelmsgymnasium blieb bis heute im Brennpunkt der Diskussion um neue Bildungsideale. Neue Forschungsergebnisse aus Quellenstudien zu den Institutionen des Kollegs, zu Schulhandschriften, Bildungspolitik und Architekturgeschichte.